柯南vs怪盗基德国语在东京这个大都会区，由于犯罪事件的层出不穷，警视厅为了要应付接连不断之桉件，便新设立了「搜查一课9系」这个单位。　　以迦纳伦太郎为首的搜查一课9系，与部下六位刑警一同解决困难棘手的桉件。